Родился Яков Конюшенко в поселке Талдысай Хобдинского района Актюбинской области в большой семье. Окончил начальную школу. Подростком трудился на сельхозработах. Вступил в колхоз «Серп и молот».
С 1937 года стал комбайнером. Во время войны все жители села работали в едином коллективе, с утра до ночи трудились в поле, чтобы вырастить урожай, борясь при этом за каждое зернышко. На передовой колхозного труда был и механизатор Яков Конюшенко. Вместе с сельчанами он выполнял тяжелую работу, занимался ремонтом техники, участвовал в посевной и сборе урожая…
После войны Якова Эммануиловича перевели заведующим мастерской Талдысайской МТС. Работал главным механиком, бригадиром полеводческо - тракторной бригады. Состоял в членах правления колхоза, был одним из активистов села. Всю жизнь прожил в Талдысае.
За многолетний и добросовестный труд награжден трудовыми медалями, отмечен почетными грамотами и благодарственными письмами со стороны колхоза.